臺海兩岸間簽署海運協議，並進行兩岸貨櫃海運直航，至今滿3週年，但由於兩岸間對於直航之運力、船籍、航商資格、貨源種類進行設限，始得直航僅對我方帶來益處。本計畫在直航對我國港口營運之影響過程中，發掘出五大重要課題。