經過夏季的九校戰後，秋天即將到來。而秋天正是全國高中生發表魔法學、魔法工學相關論文的大活動「論文競賽」的季節！由於九校戰的意外，今年達也被臨時選為代表隊成員。就在忙於準備論文的同時，兩兄妹的後母司波小百合，竟然拿了麻煩的聖遺物前來找達也，要達也幫忙分析，這也將達也捲入更大的麻煩中……一波未平一波又起的橫濱騷亂篇，即將開始！