這次由國立臺灣歷史博物館與澎湖生活博物館合作舉辦之「異文化的相遇：臺灣的機會與選擇」巡迴特展，除了原有展示內容外，特別增加有關澎湖豐富的異文化相遇的歷史與故事，包括1604年澎湖與荷蘭人的初會、馬公港的出水文物、基督長老教會來澎湖設教、清法戰爭等等內容。