臺東縣史自治篇承續民國89年(2000)政事篇內容，針對近年來臺東縣政府各項施政，第芳政府組織變革、人口特性、選舉結果、第芳政治發展等面向進行統計與說明，並詳述地方重大事件之脈絡，紀錄臺東20年來的發展樣貌與政治變遷。